Для зменшення болю та запалення використовують нестероїдні протизапальні препарати при епідидиміті: Ібупрофен, Німесулід, Диклофенак, Аспірин у формі таблеток, капсул або розчину для внутрішньом'язових ін'єкцій. Дітям рекомендується застосування ректальних супозиторіїв.
Призначають антибіотикотерапію. Найкраще в тканину придатка та яєчко проникають антибіотики групи фторхінолонів, тому препаратами вибору будуть ціпрофлоксацин, моксифлоксацин.
Хірургічне лікування гострого та хронічного епідідиміту Епідідімектомія – видалення запаленого придатка. Пункція з мошонки – дозволяє нормалізувати тиск у мошонці та усунути біль. Часткова резекція придатка – резекція зони з великим скупченням гною. Надсічка – розтин мікроабсцесів та очищення придатка.