Протікає територією міських округів Сонячногірськ, Істра та Красногорськ. Впадає в Москву-річку за 247 км від її гирла, навпроти села Знам'янського Одинцівського району. Довжина – 113 км, площа басейну, що включає близько 190 водотоків загальною протяжністю 885 км, – 2050 км.
Істра бере свій початок у Московській області і в ній завершує своє існування, впадаючи в Москву-річку. Виходить, Істра — річка областного масштабу. Вона протікає по території трьох районів – Сонячногірського, Істринського та Красногорського.
Протікає у південно-західному напрямку вздовж кордону областей територією Темкінського та Ізносковського районів. Виток — на південний схід від села Горки, впадає в річку Краду за 41 км від її гирла по лівому березі. Довжина річки складає 43 км, площа водозбірного басейну – 410 км².