Жіноча статева система представлена яєчниками, які підвішені на брижі до спинної сторони порожнини тіла з боків хребта. Яйцеводи (мюллерові канали) також підвішені на брижі. У передню частину порожнини тіла яйцеводи відкриваються щілинними отворами – воронками.
Запліднення відбувається у верхньому відділі яйцеводи. Виділення секреторних залоз середньої частини яйцеводи утворюють навколо яйцеклітини (жовтка) білкову оболонку, слабо розвинену у змій та ящірок, і потужну – у черепах та крокодилів (рис. 15).
Черепахи, крокодили, змії, ящірки відкладають яйця, з яких з'являються на світ маленькі дитинчата. Їх дитинчата нічим не відрізняються від своїх батьків, крім розмірів. Птахи відкладають яйця і дбають про своє потомство. Вони будують гнізда і висиджують у яких яйця, зігріваючи теплом свого тіла.
У всіх рептилій проходить внутрішнє запліднення, після чого зародок починає розвиватися у яйці. Усередині нього є всі важливі компоненти для благополучного розвитку нового життя. Самка відкладає яйця у вологий пісок, де проходить процес розвитку та збільшення яйця.