Просторова ізомерія Вона характерна для з'єднань з кратними зв'язками та циклічних з'єднань. Такі ізомери мають різні фізичні та хімічні властивості. Кожен атом вуглецю повинен мати різні заступники, інакше такий вид ізомерії не має сенсу.
Алкени, мають у кожного з двох атомів вуглецю при подвійному зв'язку різні заступники можуть існувати у вигляді двох просторових ізомерів, що відрізняються розташуванням заступників щодо площини π-зв'язку.
Алкани, аміни та арени не мають міжкласових ізомерів.