Люди освоїли саянські міжгір'я приблизно 35-40 тис. років назад: від тих часів залишилися кам'яні знаряддя, знайдені на первісних стоянках, наприклад, в районі Афонтової гори.
З Алтайською гірською системою гірський хребет Саяни пов'язує гірський вузол Шабін-Давана. Саяни, З геологічної погляду, дуже молоді гори, що утворилися близько 400 млн. років тому. Незважаючи на це, вони складені древніми породами, включаючи вулканічні.
Гори утворилися за рахунок нерівномірного розповсюдження ерозійних процесів. Ця територія в давнину випробувала тектонічні підняття. За розмірами та висотою гори не поступаються аналогам «вторинного орогену». На найвищих масивах відкрито щонайменше 190 льодовиків.
Східні Саяни – це гірська система в Південному Сибіру, розташована на території Росії та Монголії, що простяглася з північного заходу на південний схід від правобережжя Єнісея до озера Байкал, і разом із Західним Саянами утворює Саянські гори. Утворилися гори в палеозої (приблизно 500 млн.)