Найкраще вони зберігають схожість за температури 18-25° і вологості 50-70%. Варто уникати проморожування насіння, що зберігається. Крім того, їм категорично протипоказане підмокання. Набряклі, а потім знову висушені насіння гарбуза втрачають схожість.
Щоб насіння стало максимально смачним і корисним, його потрібно замочити, щоб позбавитися ферментів і полегшити їх перетравлення. Замочування сирих горіхів, насіння та зерен допомагає активувати процес проростання і робить мінерали, вітаміни, жири та білки більш доступними для засвоєння.
Купуючи насіння гарбуза, слідує вибирати ті, які мають рівне забарвлення, сухі, без темних плям, слідів плісняви чи гнилі. Вважається, що неочищене насіння кращетому що в них відсутні добавки, і тому вони більш корисні.