У більшості випадків розумним вибором є МРТ 1,5 Тл. Сучасні 1,5 Тл МР – томографи з багатоканальними фазованими котушками, як і раніше, є золотим стандартом обстеження при більшості патологій, в т. ч. в онкології.
МРТ 3 Тесла статистично значно перевищує МРТ 1,5 Тесла у діагностиці епілептогенних вогнищ у головному мозку. Діагностика нейроваскулярної компресії при невралгіях черепних нервів на томографі 3 Тесла відобразила найкращу деталізацію черепних нервів, їхніх гілок, дрібних судин.
Також вибір типу апарату залежить від мети дослідження. Так в апаратах закритого типу краще фіксується голова, що дає точні результати під час обстеження головного мозку. Томографи відкритого типу можуть використовуватися для оперативних втручань, оскільки дозволяють візуалізувати операційне поле.