У іригатор можна заливати тільки воду та спеціальні бальзами для іригатора. Ополіскувачі для ротової порожнини сильно піняться всередині резервуара, а трав'яні настої дають осад. Все це може швидко вивести пристрій з ладу.
Можна використовувати воду з-під крана, якщо вона не надто жорстка. Трав'яні відвари можуть спричинити відкладення в системі іригатора, через що його потрібно буде чистити частіше, ніж звичайно, або навіть зламати прилад. Стоматологи рекомендують використовувати спеціальні бальзами, які можна додавати у воду перед процедурами.
Самостійно приготовлені засоби на основі хлоргексидину або перекису водню теж не можна застосовувати вони можуть зруйнувати емаль, призвести до пересушування слизової оболонки і ясен, стати причиною стоматиту.