Після втручання може з'явитися болючість, оскільки травмується стінка піхви, ушкоджуються артерії та вени в яєчниках. Внаслідок цього в одних жінок сильно болить живіт поле пункції фолікулів, а в інших – лише незначно.
Після пункції фолікулів Після процедури можливі сонливість, помірні болючі відчуття внизу живота, мізерні кров'янисті виділення з піхви, які можуть спостерігатися 1-3 дні. Допустиме підвищення температури до 37,5 °C.
Після того як яйцеклітини отримані, чоловік здає сперму. Ембріолог оцінює її якість та готує до запліднення. Зрілі підготовлені яйцеклітини поміщаються в живильне середовище разом із сперматозоїдами. Далі один із них проникає в ооцит, як і в природних умовах.
Відновлювальний період після пункції фолікулів може тривати від 1 до 6 тижнів залежно стану здоров'я жінки.