Спочатку насіння набухає, а потім починає проростати. Насіннєва шкірка тріскається, і з'являється корінь, який розвивається із зародкового корінця. Корінь росте і зміцнюється у ґрунті.
У процесі проростання підвищується обмін речовин у зародку та ендоспермі; насіння набухають у воді, крохмаль, жири та білки розпадаються на цукор, жирні кислоти та амінокислоти. Зазвичай першим проростає корінець, далі гіпокотиль або епікотиль (у різних рослин).
Фаза набухання насіння починається з моменту появи в насінні вільної вологи (тобто при вологості вище критичної), що активізує життєдіяльність клітин, посилює гідролітичні процеси, переводить в активний стан ферментну систему, веде до перебудови колоїдів.
Насіння розвивається на поверхні насіннєвої луски. Воно є багатоклітинною структурою, що об'єднує запасну тканину – ендосперм, зародок і спеціальний захисний покрив (насіннєву шкірку). До запліднення у центральній частині сім'язачатка є нуцеллус, який поступово витісняється ендоспермом.