Весь цикл ІКСІ ЕКО займає 4-6 тижнів. Для забору статевих клітин парі потрібно провести в клініці цілий день. Через 2-6 діб жінці необхідно повторно прийти до клініки для імплантації ембріона.
Підготовка до ЕКЗ ІКСІ складається із стимуляції овуляції жінки, яка полягає у щоденних гормональних ін'єкціях під контролем лікаря за допомогою УЗД. Потім в той самий день забирають дозрілі яйцеклітини і сперму. Якщо чоловік не може дати сперму природним шляхом, вона забирається за допомогою пункції.
Ембріолог вивчає під мікроскопом сперматозоїди, відбирає (по одному) найбільш рухливі з них і не мають морфологічних дефектів, знерухомлює їх, перебиваючи хвостик, після чого засмоктує в мікроголку. Далі ембріолог присмоктує яйцеклітину мікроприсосокою і акуратно впорскує в неї. сперматозоїд мікроголкою.