На оброблюваних ділянках слизової може відчуватися пощипування – це нормальна реакція, лякатися цього не потрібно. Протягом 30 хвилин не можна пити і є, щоб не змити ліки передчасно.
Засіб застосовують місцево, для полоскання порожнини рота 2-3 рази на добу, після їди або в проміжках між прийомами. Не ковтати. Чи не розбавляти.
Призначається всередину та місцево. При застосуванні внутрішньо у дорослих 5 мл хлорофіліпту розводять у 30 мл води. Для санації кишечника при стафілококовому носійстві та профілактики післяопераційних ускладнень препарат призначають 3 рази на день за 40 хвилин до їди щодня протягом 2-3 тижнів.