Застосування препарату з профілактичною метою проводиться протягом, як правило, декількох місяців або років, а часто протягом усього життя. Для лікування зоба у новонароджених здебільшого достатньо 2-4 тижнів; у дітей, підлітків та дорослих зазвичай потрібно 6-12 місяців або більше.
Як приймати, курс прийому та дозування Йодомарин приймають внутрішньо. Дітям віком від 3 до 14 років по 2 шт. Дітям старше 14 років за 3 шт. Не рекомендується перевищувати добову дозу!
Глобальні рекомендації ВООЗ визначають обов'язкові щоденні дози йоду у кількості 90-120 мкг для дітей, 150-200 мкг для дорослих, 250 мкг для вагітних та акцентують увагу на використанні йодованої солі та препаратів калію йодиду для профілактики дефіцитних станів.