Можливе поєднання ректального (у вигляді високих клізм) та перорального (через рот) застосування препарату. Курс лікування 5-15 днів. При рецидивному перебігу захворювання можливе проведення повторних курсів лікування.
У 1917 році канадський бактеріолог Ф. Д'Ерелль незалежно від Туорта повідомив про відкриття вірусу, що «пожирає» бактерії. бактеріофага. Цікавий факт: при нанесенні бактеріофага на вологі слизові він за 20 хвилин очищає їх від певного виду бактерій, наприклад від стафілокока.
За необхідності тривалість курсу лікування можна, можливо збільшити ще на 2-3 дні. Дітям віком до року Інтесті-бактеріофаг призначають по 5 мл, від 3-х до 8-ми років – 20 мл, дітям старше 8-ми років і дорослим – по 30-40 мл на прийом 3-4 рази на добу. Протипоказань до застосування "Інтесті-бактеріофагані.
Внаслідок клінічного випробування підтвердилося, що бактеріофаги абсолютно нешкідливі для людини – вчені не зафіксували значних побічних дій препарату. За заявою авторів дослідження, результати випробування надають перші достовірні докази нешкідливості. бактеріофагів для людини.