Плодоносити сибірський кедр починає в середньому через 60 років, іноді і пізніше. Рясне насіння повторюється через три-десять років.
У сприятливих умовах плодоношення майже щорічне, у суворих кліматичних умовах може наступати лише раз у чотири – шість років. Середньорослі ялиці з гладкою корою доживають до 200 років, рідше до 250 років, високорослі товстокорі ялиці доживають до 400 років.
Рослина однодомна, на гілках одного дерева дозрівають чоловічі та жіночі колоски. Шишки кедра прямостоячі, подовжені, блакитнуватого відтінку, але з дозріванням буріють. Плодоносити дерево починає пізно, перші шишки з'являються у віці 20-25 років. Дозріває шишка 2-3 роки, насіннєвий матеріал розсипається восени та взимку.
Якщо весна рання, кедр починає цвісти з 10 червня, масове цвітіння – 16-17 червня. За сприятливої погоди (теплої, сухої) у кедра починається запилення через 2-4 дні після масового цвітіння.