Електромагнітні хвилі впливають на організм людини. Вони змінюють склад крові, зменшуючи гемоглобін, збільшуючи кількість білих кров'яних тілець. Також НВЧ-випромінювання змінює склад «корисного» холестерину з високою щільністю, що сприяє утворенню бляшок у судинах.
Чим загрожує використання мікрохвильової печі Ряд вчених стверджують, що під час нагрівання в мікрохвильовій печі відбувається іонізація продуктів. У процесі роботи атоми втрачають електрони, у результаті молекулярний склад їжі змінюється, і частіше — на користь людини.
У процесі експлуатації захист мікрохвильових печей може порушуватися (руйнування захисної плівки на склі, ущільнювача на дверцятах тощо), тому користувачу не слід перебувати на відстані ближче 50 см від працюючої печі.
Впливаючи на молекули їжі, мікрохвилі змушують воду, що знаходиться в них, обертатися так швидко, що за рахунок створюваного тертя нагрівається сама їжа. Тертя між молекулами води та іншими молекулами в їжі розриває та деформує їжу зсередини. Науковою цей процес називається структурною ізометрією.