ІІІ етап, клітинне дихання (кисневий) СО2 виділяється з мітохондрій у довкілля. Атом водню входить у ланцюг реакцій, кінцевий результат яких — синтез 30(у деяких випадках більше) молекул АТФ.
Весь катаболізм умовно поділяється на три етапи, що включають реакції загальних та специфічних шляхів.
3) Етап повного розпаду (відбувається в мітохондріях клітин, причому виключно в аеробних умовах).
Продукти, одержані на другій стадії катаболізму, вступають у третю стадію, яка відома як цикл трикарбонових кислот (термінальне окиснення, цикл лимонної кислоти, цикл Кребса).