Вибирають після того, як вивелося понад 70% каченят і в них повністю висох пух. При інкубації яєць мускусних качок укладання 38 яєць в лотки проводять не в похилому або вертикальному положенні гострим кінцем вниз, як у звичайних качок, а горизонтальному, що забезпечує кращий розвиток ембріона.
В результаті, обприскування яєць під час інкубації стало стандартною процедурою. Його починають десь між 10 та 14 дібами, і продовжують до перекладки яйця. Візки необхідно прибрати з інкубаційної шафи; яйце обприскується холодною або холодною водою і потім повертають в інкубаційну шафу.
Збирати 3-4 десь у день. Знесені після 6 години вечора краще не інкубувати. Перед збиранням яєць мити руки. З гнізда яйце брати двома пальцями за протилежні кінці, щоб не пошкодити захисну плівку.