При цьому Східну Бенгалію включили до складу домініону Пакистан (інша частина — Західна Бенгалія — відійшла до Індії), а 1956 року перейменували на Східний Пакистан. 1971 року Східний Пакистан після кровопролитної народно-визвольної війни здобув незалежність і став державою Бангладеш.
У XVI столітті Пакистан входить до складу Імперії Великих Моголів. Влада моголів намагається оскаржити пуштуни-суриди. У XVIII столітті виникли феодальні держави у Сінді, Белуджистані, Пенджабі. Найбільшим із них була Сикхська держава зі столицею в Лахорі та пуштунська Дурранійська імперія.
Приводом для розбіжностей є питання належності Нагірного Карабаху. Пакистан підтримував територіальну цілісність Азербайджану як під час, так і після карабахської війни. Також Пакистан не визнає геноциду вірмен 1915 року. Пакистан визнав Ходжалінську різанину.