За несприятливих умов розмножуються статевим шляхом: у клітинах водорості з'являються гамети; потім ці гамети попарно зливаються і утворюють зиготу, яка перебуває у стані спокою до настання сприятливих умов.
У багатьох організмів, здатних і до статевого, і до безстатевого розмноження (наприклад, у інфузорій) статеве розмноження відбувається в несприятливі умови середовища, а при оптимальних умовах переважає безстатеве.
Основні способи розмноження у водоростей – Вегетативне, безстатеве і статеве. Вегетативне розмноження – це розмноження окремими частинами слані або розподілом клітини на дві нової сотою. Якщо при такому розподілі клітини залишаються пов'язаними за допомогою слизу, утворюються колонії.
Водорості розмножуються безстатевим шляхом (фрагментація та розподіл слані, сооспорами) та статевим шляхом (кон'югація та за допомогою гамет). Мохи розмножуються безстатевим способом (спорами) та статевим (за допомогою гамет).