Вперед, назад та повороти обробляються так само, як ви керуєте автомобілем за допомогою WASD. Єдина різниця у підводній навігації полягає в тому, що ви також можете підніматися та опускатися по глибині. Використовуйте клавішу SHIFT, щоб спливти. Щоб поринути глибше, використовуйте CTRL.
Для занурення підводного човна приймає баласт – воду – в цистерни. Для випливання баласт продувається: вода витісняється з цистерн стисненим повітрям. Коли човен повністю занурена, вона змінює глибину за допомогою кермів. Прийом або відкачування баласту після цього провадиться тільки для врівноважування.
Достовірно відомо, що американські підводні човни типу "Трешер" мали робочу глибину занурення 1300 футів (близько 400 метрів). Робоча глибина занурення підводних човнів типу «Сівулф» офіційно становить «понад 800 футів», імовірно вдвічі більше за цю величину (близько 480 метрів).