Врятувати ніяк не можна. Мінімальні збитки фракціям лише наприкінці за Мінітменів (буде знищено Інститут, а Братство Сталі та Підземка залишаться живими та лояльними до протагоніста).
При проходженні цього квесту Виживому доведеться вибрати бік і назавжди стати ворогом для опонента. У випадку з Інститутом йому згодом доведеться атакувати базу Братства і, перепрограмувавши Ліберті Прайма, знищити Прідвен.
Якщо вбити Батька під час розмови на руїнах Інституту у квесті «Вигнання» з'явиться завдання «Повернутися до Інституту». Телепортувавшись туди, герой опиниться в замкненій кімнаті телепорту, де з ним зв'яжеться один із вчених і звинуватить його у вбивстві Батька.