Головний мозок рептилій ширший і масивніший, ніж у амфібій, особливо у крокодилів та черепах. Для рептилій характерні також згинання стовбура мозку і прагнення великих півкуль насунутися на проміжний і середній мозок, що лежать позаду них.
Як і у більшості хордових тварин, центральна нервова система плазунів представлена головним (з 5 відділів) та спинним мозком. Головний мозок розташований усередині черепа.
Частини «триєдиного мозку» reptilia – плазуни) – згідно з гіпотезою триєдиного мозку являє собою найдавніша сформована в процесі еволюції частина головного мозку людини, яка відповідає за біологічне виживання та тілесне функціонування.
Кінцевий мозок птахів (telencephalon), як і мозок ссавців, відноситься до інвертованого типу і складається з двох великих півкуль (hemispheria cerebri), розділених глибокою поздовжньою щілиною. У птахів поверхня півкуль, як правило, рівна і не має звивин, характерних для мозку більшості ссавців.