Кімнатна муха є переносником різних збудників небезпечних кишкових інфекцій (сальмонели, стафілококи, ротавіруси, шкідливі штампи Е. coli та ін), а також яєць глистів, очних захворювань та туберкульозу.
Оскільки в основний раціон мух входять зіпсовані залишки їжі, продукти життєдіяльності живих організмів та інші нечистоти, вони можуть переносити з них збудників безлічі небезпечних інфекцій. Серед них варто відзначити такі як дизентерія, гепатит, холера, туберкульоз та різні глистові захворювання.
Імаго багатьох мух є механічними переносниками збудників різних бактеріальних захворювань та гельмінтозів. Мухи механічно переносять збудників кишкових інфекцій (холери, дизентерії, черевного тифу), туберкульозу, дифтерії, паратифів, сибірки та цисти найпростіших.
Через те, що більшу частину життя мухи проводять у насиченій небезпечними бактеріями середовищі, є переносниками різних захворювань. На лапках і крильцях комах можуть бути яйця глистів, збудники кишкових інфекцій (сальмонельозу, холери, дизентерії, тифу), туберкульозу тощо.